わたしは、SExtractorで星検出をする前に、PinPoints(MaxIm DLについてきたPinPoints LE)で、座標決定をして、予めWCSをFitsヘッダに書きこんでおいています。
撮影に、MaxIm DLやACP Observatory Conntolollerを使っていれば、追加投資なしですが、PinPointだけ買おうと思うと高いです。
で、プロは、WCStoolsを使うのが一般的のようです。SExtratorの吐き出したx,y座標とカタログを比較して、WCSを決めます。
SciSoftにも、入っているはずなので、後で試そう?
#あ、OSXには、カタログ入れてないや、オンラインで引く?いや、ローカルに入れろ>自分
#HDDの空きがないのが辛いですが。