meineko’s blog

元つくばの某独立行政法人勤務の植物屋です。最近は、ほぼ、突発天体の話題です。

Bioconductor Case Study

Amazonに頼んであったのが届きました。
多少、How toぽいところもあるけれど、参考になりそうな本です。
#演習もあるし、教科書を想定して書かれた本??


Diffrential Expressionの章を読んで、FDRについては、手順が間違いでなかったのが確認できました。
empirical Bayers moderationとか、Receiver Operator Characteristicというのも出てきます。
勉強しないと。

Bioconductor Case Studies (Use R!)

Bioconductor Case Studies (Use R!)

この本に限らず、説明用のサンプルデータとしてBioconductorについてくるALLパッケージのデータを使うことが多いのですが、そのため、操作内容がblack box化してしまって、理解しづらいことが多いです。
まぁ、実際に、1回、書いている通りに手を動かしてみればいいのかもしれませんが。