meineko’s blog

元つくばの某独立行政法人勤務の植物屋です。最近は、ほぼ、突発天体の話題です。

2008-02-28から1日間の記事一覧

microarrayデータの閲覧ツール

PC

研究室内で、この遺伝子の発現を見たいので、過去行なったmicroarray実験のデータが欲しいというリクエストが日常的にきます。今やっているデータの解析が終わったら、こちらにも、手をつけないと?MySQLにデータを格納というのは、使いやすいツールもあった…

080227

昼間、雲が多かったので油断していたら、夕方から快晴でした。 QX Pupを撮ろうとM46に向けたら、南中を過ぎていたらしく、望遠鏡が反転しようとします。 CCDとか、ケーブルがいっぱい+ベランダ狭いので、危ないので、あわてて止めて、望遠鏡をだまして、M46…

microarray解析の手順の自動化

Rのスクリプトと、GnuWin32の力を借りたバッチファイルで、共同研究者と協議して決めた遺伝子の選抜方法を、自動化する作業中です。 これで、microarrayデータの前処理が変わって、解析に用いる元データセットが変わっても、少ない手順で再解析ができます。 …